MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 13314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015554	ACGCTT	2	12	43	54	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015554	TTAA	2	8	105	112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015554	TCAA	2	8	225	232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015554	ATT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015554	TTG	2	6	526	531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015554	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015554	TTC	3	9	609	617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015554	GC	3	6	621	626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015554	GTT	2	6	653	658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015554	AT	3	6	3503	3508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015554	TATC	2	8	3514	3521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015554	TGG	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015554	TTC	2	6	3548	3553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015554	GCT	2	6	3558	3563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015554	TTA	2	6	3573	3578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015554	CTT	2	6	7176	7181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015554	T	6	6	7198	7203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015554	TTACAC	2	12	7235	7246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015554	TCC	2	6	7269	7274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015554	C	9	9	7306	7314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_015554	A	8	8	7315	7322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015554	GTA	2	6	7341	7346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015554	AGTG	2	8	7385	7392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015554	ATA	2	6	7404	7409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015554	AGA	3	9	7418	7426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015554	TTA	2	6	7442	7447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015554	CGC	2	6	7468	7473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015554	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015554	GGC	2	6	7508	7513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015554	TTAA	2	8	7574	7581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015554	ATA	2	6	7586	7591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015554	A	8	8	7615	7622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015554	AGC	2	6	7682	7687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015554	A	6	6	8160	8165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015554	CTTA	2	8	8200	8207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015554	GCT	2	6	11211	11216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015554	A	6	6	11960	11965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015554	TAT	2	6	13039	13044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015554	CTT	2	6	13063	13068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015554	ATA	2	6	13123	13128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015554	AAT	2	6	13165	13170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015554	A	6	6	13211	13216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015554	CTT	2	6	13358	13363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015554	TAT	3	9	13396	13404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015554	AAT	2	6	13466	13471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015554	CAA	2	6	13493	13498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015554	TTAA	2	8	13499	13506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015554	AT	3	6	13516	13521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015554	AAAG	2	8	14990	14997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015554	GA	3	6	15026	15031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015554	AT	3	6	15049	15054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015554	TTTAAG	2	12	15111	15122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015554	TTTC	2	8	15137	15144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015554	A	7	7	15174	15180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015554	AAT	2	6	15260	15265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015554	A	6	6	15270	15275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015554	TAA	2	6	15290	15295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015554	TGG	2	6	18215	18220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015554	ATAA	2	8	18242	18249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015554	ATC	2	6	18254	18259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015554	TAA	2	6	18279	18284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015554	TCA	2	6	18390	18395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015554	T	9	9	18428	18436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015554	TTA	2	6	18492	18497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015554	T	8	8	18502	18509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015554	TCGGC	2	10	18547	18556	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015554	AGG	2	6	18564	18569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015554	GTA	2	6	19258	19263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015554	TAA	2	6	19314	19319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015554	TCAG	2	8	20805	20812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015554	TTA	2	6	21595	21600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015554	ATT	2	6	22011	22016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015554	T	6	6	22022	22027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015554	ATT	2	6	22054	22059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015554	ACT	2	6	22075	22080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015554	GTAT	2	8	22094	22101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015554	T	6	6	26432	26437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015554	TAG	2	6	26474	26479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015554	GAA	2	6	26548	26553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015554	TTA	2	6	27622	27627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015554	TTC	2	6	31413	31418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015554	GTC	2	6	31527	31532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015554	AC	3	6	31544	31549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015554	AC	3	6	31555	31560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015554	TA	3	6	32264	32269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015554	CTT	2	6	32275	32280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015554	AAGC	2	8	33639	33646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015554	TA	4	8	34201	34208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015554	GAA	2	6	34250	34255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015554	TG	3	6	34331	34336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015554	TG	3	6	34347	34352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015554	T	6	6	34388	34393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015554	AAC	2	6	34459	34464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015554	ACT	2	6	34485	34490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015554	AAAT	2	8	34538	34545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015554	AGACA	2	10	34672	34681	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015554	TG	3	6	34685	34690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015554	CA	3	6	34709	34714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015554	ACG	2	6	34715	34720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015554	AT	3	6	34732	34737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015554	GGC	2	6	34776	34781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015554	GAT	2	6	34827	34832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015554	AG	3	6	34956	34961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015554	GCA	2	6	35081	35086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015554	GT	3	6	35134	35139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015554	GAA	2	6	35140	35145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015554	TAG	2	6	35187	35192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015554	AAC	2	6	35217	35222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015554	AGA	2	6	35223	35228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015554	CAG	2	6	35249	35254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015554	GGA	2	6	35440	35445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015554	CTA	2	6	35553	35558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015554	GAA	2	6	35703	35708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015554	TGC	2	6	35779	35784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015554	GTC	2	6	35791	35796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015554	TCGTG	2	10	35800	35809	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015554	GGA	2	6	35903	35908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015554	GAC	2	6	35916	35921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015554	TCA	2	6	35928	35933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015554	AC	3	6	35954	35959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015554	AC	3	6	36123	36128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015554	AGT	2	6	36163	36168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015554	CCT	2	6	36264	36269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015554	TAGTG	2	10	36296	36305	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015554	TTGTT	2	10	36316	36325	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015554	GAA	2	6	36333	36338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015554	CGC	2	6	36390	36395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015554	TTA	2	6	36560	36565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015554	GCCT	2	8	36638	36645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015554	AGG	2	6	36653	36658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015554	CAG	2	6	36660	36665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015554	CCA	2	6	36683	36688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015554	ATCA	2	8	36782	36789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015554	TACT	2	8	36820	36827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015554	ACTTG	2	10	36833	36842	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015554	AAG	2	6	36899	36904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015554	TTC	2	6	36989	36994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015554	TAA	2	6	37010	37015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015554	TTA	2	6	37027	37032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015554	CGA	2	6	37071	37076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015554	GAA	2	6	37131	37136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015554	AT	3	6	37328	37333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015554	TAG	2	6	37407	37412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015554	GCGA	2	8	37415	37422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015554	GTTT	2	8	37510	37517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015554	G	6	6	37564	37569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015554	TCC	2	6	37574	37579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_015554	AGC	2	6	37773	37778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015554	TAG	2	6	37865	37870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015554	GGA	2	6	37995	38000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015554	CTG	2	6	38494	38499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_015554	ACC	2	6	39433	39438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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289	NC_015554	TTA	2	6	49068	49073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015554	CGG	2	6	49192	49197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_015554	TGAAAT	2	12	49301	49312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015554	TAC	2	6	49366	49371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_015554	TG	3	6	49441	49446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015554	ACC	2	6	49463	49468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_015554	TGG	2	6	49523	49528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015554	TCC	2	6	49549	49554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
297	NC_015554	GGA	2	6	49566	49571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015554	AGCT	2	8	49626	49633	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
299	NC_015554	GACA	2	8	49643	49650	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
300	NC_015554	GGT	2	6	49686	49691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015554	CGG	2	6	49773	49778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_015554	TCA	2	6	49801	49806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_015554	CGT	2	6	49881	49886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_015554	GAT	2	6	49921	49926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
305	NC_015554	GCT	2	6	49935	49940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_015554	GTT	2	6	50101	50106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
307	NC_015554	AGT	3	9	50252	50260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
308	NC_015554	GATT	2	8	50276	50283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
309	NC_015554	ATT	2	6	50313	50318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_015554	CAAGC	2	10	50575	50584	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
315	NC_015554	GAA	2	6	50593	50598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_015554	TAA	2	6	51325	51330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_015554	AT	3	6	51378	51383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_015554	TTAA	2	8	51424	51431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_015554	ATT	3	9	51457	51465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_015554	AGGC	2	8	52487	52494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
326	NC_015554	TGAT	2	8	54207	54214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
327	NC_015554	A	6	6	54230	54235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_015554	ACA	2	6	54257	54262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
329	NC_015554	CCA	2	6	54475	54480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
330	NC_015554	T	6	6	54482	54487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_015554	TGA	2	6	54554	54559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
332	NC_015554	GCTC	2	8	54579	54586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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335	NC_015554	T	6	6	55966	55971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_015554	CCAT	2	8	56029	56036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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338	NC_015554	CCAT	2	8	56138	56145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
339	NC_015554	AG	3	6	56174	56179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
340	NC_015554	CCTT	2	8	56199	56206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
341	NC_015554	CCAT	2	8	56264	56271	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
342	NC_015554	CT	3	6	56326	56331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
343	NC_015554	TCT	2	6	56659	56664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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352	NC_015554	TCT	2	6	56959	56964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_015554	A	6	6	89006	89011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_015554	ATCA	2	8	89031	89038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
422	NC_015554	ATTT	2	8	91134	91141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015554	A	6	6	91165	91170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_015554	TTAT	2	8	93026	93033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_015554	ATTT	2	8	93046	93053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_015554	T	6	6	93083	93088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_015554	TTA	2	6	93120	93125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_015554	TCA	2	6	93138	93143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_015554	GAC	2	6	93167	93172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_015554	GT	3	6	93213	93218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
431	NC_015554	TCACG	2	10	93240	93249	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
432	NC_015554	TAA	2	6	93274	93279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_015554	A	9	9	93374	93382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_015554	AC	3	6	93404	93409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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457	NC_015554	TGA	2	6	98186	98191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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